Кабинет антропологии был создан в 1999 году как учебно-научное подразделение в составе исторического факультета, в 2000 году он вошел в структуру Музея археологии. Кабинет осуществляет камеральную обработку, хранение, реставрацию и каталогизацию палеоантропологических материалов, поступающих из археологических раскопок, и их последующую научную обработку.
В экспозиции музея представлены палеоантропологические находки от эпохи бронзы до средневековья, которые позволяют воссоздавать внешний облик людей прошлого, узнавать о их особенностях, здоровье, военных походах и образе жизни.